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蛋白質(zhì)組學(xué)從發(fā)現(xiàn)組學(xué)躍入臨床懷抱的跨越之旅

2024-06-05 09:30:26

齊英姿


作為蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的閃耀的質(zhì)譜雙子星,Thermo Scientific? Orbitrap? Astral? 與Stellar?協(xié)同工作,以期為我們蛋白質(zhì)組學(xué)用戶(hù)提供從未知發(fā)現(xiàn)到已知驗(yàn)證的全流程服務(wù)。作為攜帶著突破性技術(shù)的***款上市儀器,Thermo Scientific?Stellar?建立定量性能超出LC-MS/MS的金標(biāo)準(zhǔn)。接下來(lái),我們從儀器性能出發(fā),從規(guī)模(Scale)、靈敏度(Sensitivity)、特異性(Specificity)、通量(Throughput)以及定量生產(chǎn)力(Quantitative productivity)的各個(gè)維度上,對(duì)全新***代Thermo Scientific?Stellar?質(zhì)譜儀在蛋白及多肽定量的應(yīng)用進(jìn)行介紹。

靈敏度方面,不管是在單細(xì)胞水平上,還是在低豐度的PTM水平上,Thermo Scientific?Stellar?的優(yōu)異性能,都能使得我們?cè)隍?yàn)證水平上不會(huì)丟失我們的目標(biāo)肽段及蛋白,且在組間定量比較中,防止遺失掉對(duì)較小的變化的發(fā)現(xiàn)。無(wú)論是HeLa樣品還是真正的單細(xì)胞樣品,均具有良好的定量下限。從結(jié)果來(lái)看,在對(duì)單個(gè)HeLa細(xì)胞的蛋白和多肽的定量中,在覆蓋了5,000,000以上到5,000 以下的拷貝數(shù)的動(dòng)態(tài)范圍內(nèi),tMS2的采集模式共定量到包括395條肽段在內(nèi)的383個(gè)蛋白。所示舉例的較低豐度蛋白也能擁有可重現(xiàn)的定量結(jié)果。在磷酸化多肽的定量案例中,我們可以以更高的通量、更低的起始量得到更多的可定量磷酸化多肽。優(yōu)異的靈敏度,也使得在低上樣量的檢測(cè)中,兼顧更加廣泛的動(dòng)態(tài)范圍的同時(shí),得到更加完整的數(shù)據(jù)集,并***大可能減小數(shù)據(jù)的缺失。

在檢測(cè)通量方面,以PQ500試劑盒為例,血漿中的580+蛋白,超過(guò)800條多肽,依賴(lài)于Thermo Scientific?Stellar?的快速采集能力以及tMS2的優(yōu)異靈敏度,可以實(shí)現(xiàn)100SPD的絕對(duì)定量采集。提升通量的同時(shí),保證了優(yōu)異的定量靈敏度及線性響應(yīng)。

除了極其優(yōu)異的性能外,在大規(guī)模的定量檢測(cè)中,我們尤其關(guān)注于儀器的穩(wěn)健性表現(xiàn)。如圖所示,在500個(gè)樣品的檢測(cè)中,液相色譜與質(zhì)譜均表現(xiàn)穩(wěn)健,為大規(guī)模隊(duì)列的采集提供保障。

賽默飛***直致力于更好地服務(wù)開(kāi)創(chuàng)人類(lèi)健康未來(lái)的科學(xué)***,包括全新***代Thermo Scientific?Stellar?質(zhì)譜儀在內(nèi)的新***代蛋白質(zhì)組學(xué)工作流程,為廣大科學(xué)***們量身定制了從樣品自動(dòng)制備、納流液相色譜、離子淌度到人工智能增強(qiáng)型數(shù)據(jù)處理軟件的無(wú)所不包的***流實(shí)驗(yàn)室配置。這意味著廣大用戶(hù)在在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,從硬件到軟件的無(wú)縫銜接,也意味著蛋白質(zhì)組學(xué)從發(fā)現(xiàn)組學(xué)到臨床發(fā)現(xiàn)驗(yàn)證的無(wú)縫銜接。從Thermo Scientific? Orbitrap? Astral?到Thermo Scientific?Stellar?雙星閃耀,讓我們***起祝福蛋白質(zhì)組學(xué)旅程所向披靡,***往無(wú)前。


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